В соответствии с Приказом Рособрнадзора №1580 от 29 декабря 2012г. аспирантура ТувГУ успешно прошла процедуру аккредитации. Открыты новые специальности послевузовского образования: «Зоология», «Физиология», «Общая педагогика, история педагогики и образования». Аккредитованы следующие специальности: «Экология (биология)», «Строительные материалы и изделия», «Агрофизика», «Экономика и управление народным хозяйством», «Языки народов Российской Федерации», «Теория и история права и государства», «История учений о праве и государстве», «Теория и методика физического воспитания, спортивной тренировки, оздоровительной и адаптивной физической культуры», «Социальная психология», «Теория и история культуры».

На данный момент в России выделение бюджетных мест и открытие новых направлений аспирантуры все более жестко привязываются к показателям научной деятельности по соответствующим направлениям. Право на реализацию образовательных программ магистратуры и аспирантуры будут иметь только университеты, реализующие научные исследования по соответствующим направлениям. Государство планомерно добивается усиления связи между подготовкой магистров и аспирантов с возможностью их участия в реальной научной и инновационной деятельности.
Ректором ТувГУ поставлена на 2013г. задача повышения защищаемости кандидатских диссертаций аспирантов университета.